萌芽
001云霄飞车杀人事件（把工藤新一变小） 128 黑衣组织10亿元抢夺事件（灰原哀姐姐死亡的事件） 129 来自黑衣组织的女子，大学教授杀人事件（灰原哀出现） 176 黑衣组织的再会(灰原篇) 177 黑衣组织的再会(柯南篇) 178 黑衣组织的再会(解决篇) 230 谜一样的乘客（上）（赤井秀一出场，贝尔摩得扮演的新出医生救柯南，后面有一集有提及） 231 谜一样的乘客（下） 309 和黑暗组织的再会（交涉篇） 310 和黑暗组织的再会（追踪篇） 340 厕所里隐藏的秘密（前篇）（柯南帮助灰原哀拿到她姐姐留下的录音带） 341 厕所里隐藏的秘密（后篇） 345 和黑暗组织一决胜负&满月之夜的二元推理 425 黑暗冲击！组织魔爪伸出的瞬间 后面的红与黑的碰撞系列 剧场版:通向天国的倒计时 漆黑的追踪者 漫画的话 42 34 24 18 35 1 2 4 12 29 32 37 41 48 58 59 卷有出现